特殊奖学金主要指由哈工大本部下发相关要求与指标，一校三区参与联评的奖学金；以及哈工大（深圳）利用社会组织及个人爱心捐赠资金等，设立爱心奖学金。特殊奖学金各项政策主要内容如下：
n 工信创新创业奖学金
由工业和信息化部设立，奖励对象为全日制在校本科生、研究生，以团队或个人进行申报，每学年评选一次。深圳校区推荐候选人参与一校三区联评。
工信创新奖学金一等奖，奖金额度为3万元；二等奖，奖金额度为2万元；三等奖，奖金额度为1万元。工信创业奖学金一等奖，奖金额度为6万元；二等奖，奖金额度为4万元。
n 春晖创新成果奖
“哈尔滨工业大学春晖创新成果奖”由杰出校友李长春、张淑荣、王兆国、高秀芝、李继耐、孙锦云捐资发起设立。奖励对象为在籍的博士研究生、硕士研究生和本科生。奖励等级分为特等奖及一、二、三等奖。深圳校区推荐候选人参与一校三区联评。
特等奖，每位奖励2万元人民币；一等奖，每位奖励1万元人民币；二等奖，每位奖励5000元人民币；三等奖，每位奖励3000元人民币。
n 优秀学生李昌奖
“优秀学生李昌奖” 传承李昌老校长的办学思想和教育理念，发扬“规格严格、功夫到家”的优良传统，弘扬哈工大精神，通过评选和表彰，奖励为学校发展建设做出杰出贡献的教职员工和品学兼优的学生。每两学年评选一次。
“优秀学生李昌奖”颁发奖学金1万元人民币；学校将举行颁奖仪式表彰获奖师生，颁发奖状和奖牌；获奖名单和事迹材料将由学校博物馆“李昌纪念馆”永久留存。
n 共进奖学金
由深圳市共进电子股份有限公司设立，旨在激励学生勤奋学习、全面发展。奖励对象为哈尔滨工业大学（深圳）全日制本科部分专业大二学生，每位奖励8000元人民币。该奖学金每学年评选一次。
n 环境科学与工程学科“三人行”奖学金
环境科学与工程学科“三人行”奖学金由哈工大（深圳）土木与环境工程学院设立，奖励对象为环境与工程学科的全日制本科生。由学院根据每年学生实际情况开展评选工作，进行奖项、金额等方面的调整。
该奖学金分为优秀本科生一等奖学金，每位奖励7000元人民币、二等奖学金，每位奖励5000元人民币、三等奖学金，每位奖励2000元人民币；3+2 专项奖学金；每位奖励50000元人民币。
n 土木工程专业宏业基-金鹏奖学金
土木工程专业宏业基-金鹏奖学金由哈工大（深圳）土木与环境工程学院设立，奖励对象为土木工程专业的全日制本科生。由学院根据每年学生实际情况开展评选工作，进行奖项、金额等方面的调整。
该奖学金分为宏业基-金鹏优秀学生奖学金，旨在评选学习成绩优异、综合素质强的学生，每位奖励5000元人民币；宏业基-金鹏专业奋进奖学金，旨在激励学生勤奋学习，评选学习态度积极的学生，每位奖励2000元人民币。
n 机电工程与自动化学院哈工大—拓邦智能技术奖学金
哈工大—拓邦智能技术奖学金由哈工大（深圳）机电工程与自动化学院设立，奖励对象为机电工程与自动化学院在籍本科生。由学院根据每年学生实际情况开展评选工作，进行奖项、金额等方面的调整。
该奖学金分为院长奖，每位奖励12000元人民币；拓邦智能技术杰出奖，每位奖励8000元人民币；拓邦智能技术奋进奖，每位奖励2000元人民币。
